Una struttura dinamica è la chiave
della funzionalità dell'acido ribonucleico (Rna). Eppure la
caratterizzazione sperimentale delle sue configurazioni è
complessa. Uno studio della Sissa pubblicato su Nucleic Acids
Research combina dati sperimentali e simulazioni di dinamica
molecolare per ricostruire le strutture di un frammento di Rna
fornendo un metodo innovativo per l'analisi di sistemi dinamici.
"L'Rna ha un ruolo centrale nella sintesi proteica. Anche per la
struttura non statica", spiega il fisico Giovanni Bussi. "Si
parla di un insieme di configurazioni con struttura dominante e
alcune a bassa popolazione". Tecniche come la risonanza
magnetica nucleare (Nmr) permettono in teoria di sondare gli
insiemi. Però per ottenere la struttura della molecola si fa
spesso l'assunzione che esista un'unica conformazione rilevante.
"Combinando i dati Nmr con simulazioni abbiamo ricostruito
diversi stati della molecola e individuato quelli in grado di
riprodurre la struttura 'media' determinata empiricamente".
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